新宿站有 JR（山手線、中央線、總武線、埼京線和湘南新宿線）、私鐵小田急線與京王線、東京地鐵丸之內線，以及都營新宿線和大江戶線。成田特快從成田機場直達此站，機場利木津巴士停靠車站南側上方的新宿高速巴士總站（Busta 新宿）及西側各大飯店。
下列票價為使用交通卡的成人單程近似票價，可能已有調整；出行前請查詢最新價格。各機場交通方式的全城比較，請見我們的前往東京指南。
路線一覽
| 出發地 | 最佳路線 | 時間 | 大致費用 |
|---|---|---|---|
| 成田機場 | 成田特快（N’EX），直達，全車指定席 | 約 80–90 分鐘 | 約 3,250 日圓 |
| 成田機場 | 機場利木津巴士至 Busta 新宿或西側飯店 | 約 85–120 分鐘，視路況而定 | 約 3,600 日圓 |
| 成田機場 | 京成 Skyliner 至日暮里，換乘 JR 山手線 | 約 70 分鐘 | 約 2,800 日圓 |
| 羽田機場 | 機場利木津巴士，直達 | 約 35–60 分鐘 | 約 1,400 日圓 |
| 羽田機場 | 京急線至品川，換乘 JR 山手線 | 約 45 分鐘 | 約 550 日圓 |
| 東京站 | JR 中央線快速，直達 | 約 15 分鐘 | 約 210 日圓 |
| 澀谷 | JR 山手線，直達 | 約 7 分鐘 | 約 170 日圓 |
| 淺草 | 銀座線至神田，換乘 JR 中央線快速 | 約 30–35 分鐘 | 約 350 日圓 |
新宿當地交通
步行：東側景點——歌舞伎町、黃金街、花園神社和百貨公司——都在東口步行 10 分鐘範圍內。回憶橫丁緊鄰西口，都廳再往西經地下通道走 10 分鐘，新宿御苑在東南方向 10 分鐘處（或乘丸之內線一站到新宿御苑前）。
出口：出閘機前先跟著頭頂的黃色指示牌找「東口」「西口」「南口」或「新南口」；出站後再橫穿車站可能要花一刻鐘。前往河口湖和箱根的高速巴士所在的 Busta 新宿位於新南口。
