新宿站有 JR（山手线、中央线、总武线、埼京线和湘南新宿线）、私铁小田急线与京王线、东京地铁丸之内线，以及都营新宿线和大江户线。成田特快从成田机场直达此站，机场利木津巴士停靠车站南侧上方的新宿高速巴士总站（Busta 新宿）及西侧各大酒店。
下列票价为使用交通卡的成人单程近似票价，可能已有调整；出行前请查询最新价格。各机场交通方式的全城比较，请见我们的前往东京指南。
路线一览
| 出发地 | 最佳路线 | 时间 | 大致费用 |
|---|---|---|---|
| 成田机场 | 成田特快（N’EX），直达，全车指定席 | 约 80–90 分钟 | 约 3,250 日元 |
| 成田机场 | 机场利木津巴士至 Busta 新宿或西侧酒店 | 约 85–120 分钟，视路况而定 | 约 3,600 日元 |
| 成田机场 | 京成 Skyliner 至日暮里，换乘 JR 山手线 | 约 70 分钟 | 约 2,800 日元 |
| 羽田机场 | 机场利木津巴士，直达 | 约 35–60 分钟 | 约 1,400 日元 |
| 羽田机场 | 京急线至品川，换乘 JR 山手线 | 约 45 分钟 | 约 550 日元 |
| 东京站 | JR 中央线快速，直达 | 约 15 分钟 | 约 210 日元 |
| 涩谷 | JR 山手线，直达 | 约 7 分钟 | 约 170 日元 |
| 浅草 | 银座线至神田，换乘 JR 中央线快速 | 约 30–35 分钟 | 约 350 日元 |
新宿当地交通
步行：东侧景点——歌舞伎町、黄金街、花园神社和百货公司——都在东口步行 10 分钟范围内。回忆横丁紧邻西口，都厅再往西经地下通道走 10 分钟，新宿御苑在东南方向 10 分钟处（或乘丸之内线一站到新宿御苑前）。
出口：出闸机前先跟着头顶的黄色指示牌找“东口”“西口”“南口”或“新南口”；出站后再横穿车站可能要花一刻钟。前往河口湖和箱根的高速巴士所在的 Busta 新宿位于新南口。
